技術簡介

轉運RNA(tRNA)是一類具有攜帶并轉運氨基酸功能的非編碼小RNA。tRNA除了參與蛋白合成外，還參與調控多種生理病理過程。研究表明：tRNA能通過多種機制調控基因的表達，與腫 瘤、代謝疾病、神經退行性疾病甚至病 毒感 染等重大疾病的發生 發展息息相關。

成熟tRNA豐富的轉錄后修飾和二級結構都限制了傳統RNA-seq的加接頭和cDNA合成效率，云序生物的tRNA測序可以有效地去除tRNA的內部修飾和末端修飾，使得tRNA測序獲得更高的檢測效率，防止信息的丟失，為客戶提供完整的測序報告。

tRNA-seq流程圖

云序優勢
高檢測效率：
有效去除tRNA甲基化修飾和末端修飾，使tRNA-seq具有高檢測效率。
系統性 服務：
系統性提供tRNA測序、tiRNA和tRF測序、tRNA m5C甲基化測序等tRNA相關產品服務。
數據全 面：
權威的tRNA數據庫，全 面的tRNA表達譜分析。
專業的生物信息學分析：
云序生物具有強大的生物信息學團隊，能夠滿足客戶的各類深入數據分析要求。
樣本要求
樣品類型：
組織、細胞、體液或RNA樣品。其它類型樣品請詳詢。
樣品量：

a) 細胞：2×10⁶

b) 組織：50 mg

c) 體液：全血、血清、血漿2-3 ml

腦脊液：5 ml

尿液：50 ml

d) 總RNA：2 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5; 無明顯降解，電泳檢測樣品特征性條帶完整清晰，無明顯彌散或拖尾) 

樣品運輸及保存：

樣品運輸：樣品置于1.5mL管中，封口膜封好，干冰運輸 

樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊，可用TRIZOL或RNA保護劑處理，液氮凍存后，-80℃保存，RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存，樣品保存期間避免反復凍融。 

數據分析（下列有※表示個性化分析）
1、tRNA長度統計圖※

2、tRNA散點圖

3、差異表達的tRNA聚類分析

4、編碼tRNA基因啟動子motif分析※

5、反密碼子分析※

案例解析
案例1：tRNA促進乳腺ai轉移
原文：Modulated Expression of Specific tRNAs Drives Gene Expression and Cancer Progression

期刊：Cell 影響因子：31.39
本文通過tRNA測序和嚴謹的生物信息學分析，發現高轉移性乳腺ai細胞亞株MDA-LM2與CN-LM1a中某些特異性tRNA水平上調會使細胞獲得轉移能力。通過相應實驗證實，tRNA GluUUC與tRNA ArgCCG是乳腺ai轉移的助推因子。tRNA GluUUC與tRNA ArgCCG的上調會增加轉錄本穩定性及轉錄本與核糖體的結合力，這一調控作用具有密碼子特異性。特別是tRNA GluUUC可通過直接增強下游靶基因EXOSC2和GRIPAP1表達進而形成一條受tRNA驅動的“可誘導”通路，從而促進乳腺ai的轉移。

圖1. 不同細胞中差異表達的tRNA，特異性tRNA與轉移乳腺ai細胞的相關性